| TAIMEDE FOTOSÜNTEES JA SELLE SEOS KESKKONNATINGIMUSTEGA 2003-2007 sihtfinantseeritav teadusteema Lühikokkuvõte Kasutades kaasaegseid biofüüsika, füsioloogia ja molekulaarbioloogia meetodeid uuritakse tavaliste ja transgeensete taimede fotsünteesi määravaid ja piiravaid tegureid, stressifaktorite toimemehhanisme ja taimede kohastumist nendele laboratoorsetes ja looduslikes tingimustes. Tähelepanu all on niisugused fotosünteesiaparaadi parameetrid nagu fotosüsteemid II ja I, fotosüsteemide-vaheline elektronikandja tsütokroom b6f kompleks ja ribuloos 1,5-bisfosfaadi karboksülaas-oksügenaas. 1. Sissejuhatus Fotosüntees on ainuke protsess eluringes, mille käigus tekib orgaaniline aine mitteorgaanilisest, ja sellisena tema tähtsus ei vaja kommentaare, eriti arvestades ootamatult aeglast progressi termotuumaenergeetika praktilisel rakendamisel. Taimede fotosüntees määrab oluliselt meie elu kvaliteedi nii toidu, energia kui ka elukeskkonna osas ja fotosünteesi ning sellega seotud metabolismi uurimine on seetõttu üks olulisi teadusteemasid. Fotosüntees on teadustevaheline probleem, alates pikosekundiliste protsesside biofüüsikast, läbi molekulaarbioloogia, biokeemia ja füsioloogia kuni ökoloogia ja klimatoloogiani - seoses keskkonna puhtuse, ökosfääri tasakaalu ja kliima muutustega. TÜMRI taimefüsioloogia õppetooli teadustemaatika katab selle areaali üsna laialt. Käesolev teema ulatub biofüüsikast kuni füsioloogiani, selle rakendused viivad aga teadusliku aparaadiehituse tehnoloogiasse. 2. Teema teaduslik kirjeldus 2.1. Ergastuse mittefotokeemiline kustutamine fotosüsteemis II Fotosüntees algab kvandi neeldumisega mingis klorofülli molekulis, kust siis ergastus liigub edasi klorofüllilt klorofüllile, kuni jõuab nn. tsentriklorofüllile, mis ei anna ergastust edasi vaid ioniseerub, siirates elektroni nn. aktseptormolekulile. Ergastuse teel on kaod, mis on tingitud esiteks loomulikust termilisest konversioonist, teiseks aga on bioloogilise regulatsiooni tarbeks süsteemi sisse viidud konkureerivad ergastuse kustutajad. Viimaste regulatsioon tundub aga olevat ebatäiuslik: nad peaks olema täielikult väljalülitatud kui valgust on niigi vähe, tegelikult aga paljudel juhtudel, eriti stressi ajal ja järgselt, nad seda ei ole. Selle tulemusena tekivad lisakaod, mis oluliselt vähendavad fotosünteesi kvantsaagist. Oleme uurinud mittefotokeemilise kustutuse mehhanismi, et teada saada, missugused on minimaalselt võimalikud kaod, millal ja miks jäävad aktiivseks ergastuse lisakustutajad (Laisk ja Oja 1998, Oja ja Laisk 1998, Laisk ja Oja 2000, Oja ja Laisk 2000). Nendest töödest johtub järgmine küsimus: kas mittepöörduv kustutamine (fotoinhibitsioon) on klorofüll-antennis toimuva reguleeritud (‘energy-dependent’) kustutuse pikema-aegne edasikestmine stressitingimustes (sama mehaanism, aga regulaatori häire) või on tegu hoopis teise mehhanismiga? Kui õiged on mõlemad hüpoteesid, siis missugune on nende suhteline osatähtsus? Selle probleemi osas kavatseme ette võtta näiteks järgmised uuringud.
2.2. Fotosüsteemide II ja I antennide ristlõiked Paralleelsetest klorofülli fluorestsentsi, 820 nm absorbtsiooni ja CO2 sidumise kiiruse mõõtmistest on võimalik leida fotosüsteemide II ja I antennide suhtelised optilised ristlõiked (Eichelmann and Laisk 2000, Laisk et al. 1999). Seda meetodit rakendame antennide ristlõigete regulatsiooni uurimiseks. 1. PSII ja PSI antennide kohastumine valguse spektraalkoosseisu muutustele (state-transition). Kutsume esile state-transitioni valgustades lehti punase ja kaugpunase valgusega. Näitame kvantitatiivselt, kui suur kogus klorofülli eemaldadub PSII juurest selle protsessi käigus ja selgitame selle füsioloogilist tähtsust. 2. Sama meetodit kasutades uurime antennide ristlõigete suhet C4 taimedes. Nimelt, neis taimedes peaks PSI antenn teoreetiliselt olema kaks korda suurema ristlõikega kui PSII antenn, sest neis taimedes peab PSI tootma lisa-ATP CO2 transpordi mehhanismi tarbeks. Antennide ristlõike tegelik väartus C4 taimedes võimaldab teha järeldusi CO2 transpordisüsteemi energiakulu kohta neis taimedes.
2.3. Elektrontransport PSII -> PSI ja PSI regulatsioon (Osa sellest projektist finantseeritakse Eesti Teadusfondi Grant nr 5236 alt) Kui klorofüll PS II ümber fluorestseerib, siis PS I ümber mitte. Informatsiooni saab aga siiski PSI tsentripigmendi P700 redoksseisundi kaudu, mida saame registreerida 820 nm neeldumisribas. Kahjuks muutub samas ribas ka plastotsüaniini (PC) ja ferredoksiini (Fd) neeldumine, mis muudab 820 nm signaali interpretatsiooni keeruliseks. Analüüsime seda signaali, oksüdeerides PSI doonorpoolt järkjärguliselt kaugpunase valgusega. Välja on töötatud matemaatilise reegli 820 nm signaali deshifreerimiseks. Rakendades seda uut meetodit, saab 820 nm signaali abil kiiresti ülevaate PSI doonorpoolest, Cyt f, PC ja P700 hulgast ja redoks-seisundist fotosünteesivas lehes. Fotosünteetilise elektrontranspordi kiirust piiravaks astmeks on tsütokroom b6f (Cyt b6f), mis asub kahe fotosüsteemi vahel. On teada, et selle töökiirus allub regulatsioonile, kuid regulatsiooni printsiibid ja mehhanism ei ole päris selged. Eriti oluline on nn. tsükliline elektrontransport: kas üldse, ja kui, siis missugustes tingimustes elektronid pöörduvad PSI aktseptorpoolelt (läbi Cyt b6f ??) doonorpoolele tagasi transportides ekstra H+ ja võimaldades lisa ATP sünteesi? Eelmise aruandeperioodi tööd kavatseme jätkata Nendes katsetes kasutame spetsiaalselt konstrueeritud katikute abil genereeritavaid lühikesi valgus- ja pimepulsse (Eichelmann et al. 2000). Nende katsete loogika oleks lühidalt järgmine.
2.4. Rubisco, selle hulga ja aktiivsuse vahelised seosed. CO2 sidumise ensüüm C3 taimedel on ribuloosbisfosfaadi (RuBP) karboksülaas-oksügenaas (Rubisco). Varem oleme uurinud fotosünteesi kineetika ja Rubisco hulga vahelisi seoseid laboratooriumitaimedel (Eichelmann and Laisk 1998, Eichelmann and Laisk 1999). Nendes katsetes selgus huvitav tõsiasi, et Rubisco tegelik aktiivsus lehes ei ole otseselt seotud tema hulgaga. Ilmselt, Rubisco süntees on määratud ühtede faktorite poolt, tema aktivatsioon aga teiste poolt. Järgnevas teemas planeerime Rubisco hulga ja tema aktiivsuse vaheliste seoste uurimist nii laboratooriumis kui ka looduses kasvavatel taimedel. Nendest katsetest peaks selguma seosed valgu sünteesi reguleerivate tegurite (proteoomika) ja tema metaboolset aktiivsust reguleerivate tegurite (metaboolika) vahel.
2.5. Atmosfääris leiduva osooni mõju taimedele Osooni kui abiootilise stressifaktori mõju uurimine taimede füsioloogilistele kaitsereaktsioonidele on tõstatanud kogu probleemi laiemalt: milline on elusrakkudes patogeeni mõjul indutseeruva oksüdatiivse purske mehhanism ja milline on rakkude võime genereerida purske käigus hapniku aktiivühendeid (O2· - , H2O2, · OH)? 1. Olemasolevad teadmised ja hüpoteesid peroksüdaasidel põhineva oksüdatiivse purske esimese faasi kohta formuleeritakse matemaatiliste mudelitena, kvantitatiivselt kirjeldamaks selle faasi spetsiifikat katsetes rakususpensioonidega ja intaktsete lehtedega. 2.
Jätkatakse katseid, eksponeerides taimi mitmesugusel O3-doosil.
Mõõdetakse CO2 ja O2 vahetust, klorofülli
fluorestsentsi ja 820 nm signaali. Nende kaasaegsete meetodite abil loodame
detailiseerida, missugused fotosünteesiapraadi osad on osooni suhtes
kõige tundlikumad.
2.6. Transgeensete taimede kasutamine füsioloogilises uurimistöös Kuna me ise transgeenseid taimi ei valmista, siis kasutame teistest laboritest saadud materjali (Eichelmann and Laisk 2000, Eichelmann et al. 2000). Meie täiuslik aparatuur võimaldab neid uurida hoopis põhjalikumalt kui teised seda teha saavad. Näiteks oleme me kasutanud Cyt b6f defitsiitset ja Rubisco-defitsiitset transgeenset tubakat. 1. Kasutades Rubisco-defitsiitset tubakamutanti (kingitus Austraalia Rahvusülikoolilt) mõõdame, kas ensüümi hulga vähenedes tema aktivatsiooniaste suureneb või mitte. Püüame leida vastust küsimusele, mis määrab metaboolselt tähtsate ensüümide tegeliku aktiivsuse, s.t. kui suur on metaboolika roll genoomika ja proteoomika kõrval (vt. ka 2.4)? 2.7. Fotosünteesi matemaatiline mudelleerimine Kuigi matmaatiline mudelleerimine kuulub kõigi probleemide juurde niikuinii, on üks suund kogu fotosünteesiprotsessi matemaatilise mudeli väljatöötamise poole. Hiljuti ilmus meilt C4 fotosünteesi matemaatiline mudel, mis seletab CO2 pumpamise mehhanismi NADP-ja NAD-Malic-Enzyme tüüpi C4 taimedel (Laisk ja Edwards, 2001). Pikka aega ootab aga lõpetamist mudel, mis seletaks fotosünteesi võnkumisi C3 taimedel. Nende mudelite iseloomulikuks jooneks on heuristilisus, s.t. nad seletavad nähtusi, mis varem olid arusaamatud. 2.8. Mõõtmised looduslikes kooslustes Osa ülalkirjeldatud mõõtmistest kordame ka ökofüsioloogilises mastaabis, kasutades selleks katsematerjalina looduslikes kooslustes kasvavaid lehti (s.h. koostöös TÜ rakendusökoloogia õppetooliga). 2.9. Aparaadiehitus ja kommertsialiseerimine Kogu projekt on saanud võimalikuks tänu unikaalsete omavalmistatud aparaatide ja omakirjutatud kompuuterprogrammide olemasolule, mis lubavad meil mõõta ja uurida seda, mis kolleegidele võimatu (Laisk and Oja, 1998). Meie laboris valmistatud fotosünteesi mõõteaparatuur on unikaalne oma universaalsuse, täpsuse, töökiiruse ja –mugavuse (automatiseerituse) poolest. Näiteks on katsed täielikult kompuuterjuhitavad kasutades vastavalt väljatöötatud kasutajasõbralikku metakeelt. Projekti edasine areng viib väljatöötatud aparatuuri kommertsialiseerimisele, samuti ka uute, laiema turuga aparaatide väljatöötamisele. 3. Materiaalne ja inimressurss TÜMRI taimefüsioloogia õppetoolis on pikaajalise töö tulemusena saavutatud maailma tipptase taimede fotosünteesi ja sellega seotud füsioloogiliste protsesside uurimisel intaktsetel (tervetel) lehtedel biofüüsikaliste ja kineetiliste meetoditega. Meie kollektiivi eriti tugevaks küljeks tulemuste interpretatsioon matemaatiliste mudelite abil ja originaalne aparaadiehitus. Eriline rõhk on pandud protsesside kiirust määravate ja piiravate tegurite kineetilisele uurimisele nii normaalseis kui ka stressitingimustes, alates energiakonversioonist fotosüsteemides, läbi süsiniku assimilatsiooni ja lõpp-produktide sünteesi, kuni terve taime energia- ja massibilansini välja. Kollektiivi juhil on mitmekülgsed teadmised tänu pikaajalisele kogemusele (prof. A. Laisk on üks TÜ sagedamini tsiteeritud teadlasi). Vanemteadur Vello Oja on absoluutne virtuoos kineetiliste katsete korraldamises ja andmetöötluses. Teadur Hillar Eichelmannile ei ole vastast töömahukate projektide läbiviimisel (näit. COPERNICUS). Teadur Irina Bichele on omandanud kvalifikatsiooni osooni mõju uurimisel fotosünteesile. Dots. Evi Padu osaks on töömahukas Rubisco hulga mõõtmine. Kollektiiv on täienenud saksa teaduri Katja Hüve’ga, kellega meil on olnud pikaajalised kontaktid ja kes nüüd osaleb juba Taru Ülikooli töötajana meie labori töös. Tänu iseseisvale aparaadiehitusele ja viimaste aastate suhteliselt heale finantseerimisele (COPERNICUS grant, Eesti Vabariigi teadusfinantseeringud ) on laboratoorium üks maailma parimini varustatuid lehe fotosünteesi uurimiseks. Aparaadiehituses on juhtfiguur tööloa alusel Tartu Ülikoolis töötav VAK doktorikraadiga Tadzhiki päritolu Bahtijor Rasulov, talle sekundeerib insener Heikko Rämma. 4. Perspektiiv ja praktiline väljund Fotosünteesi fundamentaaluuringute perspektiiv on ikka veel suunatud lihtsale küsimusele vastuse otsimisele: mis määrab taimelehe fotosünteesi kiiruse? Ühe või teise ülalkirjeldatud limiteeriva protsessi roll võib muutuda eriti oluliseks stressisituatsioonides. Mõistes, millised on piiravad protsessid näiteks sõltuvalt valguse gradiendist koosluses, kõrgetel või madalatel temperatuuridel, suurenenud saastekoormustel, liigse või puuduliku veevarustuse juures, on võimalik teadlikult valida taimeliike või vältida letaalseid stressikombinatsioone. Teisest küljest, kaasaegne biotehnoloogia on võimeline mõjutama taimede genoomi soovitud suunas, ülalkirjeldatud fundamentaaluuringud aga aitavad planeerida biotehnoloogiliste mõjutuste suunda ja näha nende praktilist resultatiivsust. Kommertsialiseeritud teadusaparatuuri müük tähendab aga teadusmahuka tehnoloogia tegelikku juurutamist teel teaduspõhise Eesti suunas.
5. Teema alt 1998-2003 (august) CC väljaannetes ilmunud tööd:
07.07.03 Agu Laisk Teema juhendaja |
|||||